Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip10Q8CJ53 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip10Q8CJ53 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms