Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms