Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms