Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NgefQ8CHT1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms