Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkiras1Q8CEC5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkiras1Q8CEC5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms