Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE96

Trmt6, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase non-catalytic subunit TRM6, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt6Q8CE96 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Trmt6Q8CE96 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt6Q8CE96 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt6Q8CE96 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt6Q8CE96 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt6Q8CE96 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt6Q8CE96 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trmt6Q8CE96 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt6Q8CE96 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt6Q8CE96 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt6Q8CE96 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trmt6Q8CE96 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trmt6Q8CE96 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trmt6Q8CE96 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt6Q8CE96 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt6Q8CE96 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trmt6Q8CE96 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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