Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8CDS7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CDS7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CDS7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CDS7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8CDS7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CDS7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CDS7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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