Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ufl1Q8CCJ3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms