Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8CC96 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8CC96 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8CC96 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8CC96 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8CC96 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8CC96 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8CC96 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8CC96 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8CC96 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8CC96 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8CC96 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8CC96 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8CC96 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8CC96 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8CC96 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8CC96 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8CC96 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8CC96 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8CC96 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8CC96 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8CC96 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8CC96 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8CC96 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8CC96 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8CC96 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8CC96 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8CC96 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8CC96 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8CC96 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8CC96 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8CC96 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8CC96 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8CC96 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8CC96 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8CC96 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8CC96 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8CC96 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8CC96 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8CC96 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8CC96 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8CC96 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8CC96 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8CC96 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8CC96 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms