Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb2Q8CC27 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb2Q8CC27 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms