Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrn3Q8CBC6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms