Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6C7

Fam204a, Protein FAM204A, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam204aQ8C6C7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam204aQ8C6C7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam204aQ8C6C7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam204aQ8C6C7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam204aQ8C6C7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam204aQ8C6C7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam204aQ8C6C7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam204aQ8C6C7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam204aQ8C6C7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam204aQ8C6C7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms