Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot2Q8C5L3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms