Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rps6ka5Q8C050 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka5Q8C050 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms