Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim35Q8C006 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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