Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXZ0

Ctxn3, Cortexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn3Q8BXZ0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctxn3Q8BXZ0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn3Q8BXZ0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms