Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ube3dQ8BX13 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ube3dQ8BX13 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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