Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmod1Q8BVA4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms