Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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