Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms