Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnrc6bQ8BKI2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms