Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6820408C15RikQ8BJX2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
6820408C15RikQ8BJX2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
6820408C15RikQ8BJX2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
6820408C15RikQ8BJX2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
6820408C15RikQ8BJX2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
6820408C15RikQ8BJX2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
6820408C15RikQ8BJX2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
6820408C15RikQ8BJX2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
6820408C15RikQ8BJX2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
6820408C15RikQ8BJX2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
6820408C15RikQ8BJX2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
6820408C15RikQ8BJX2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms