Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan9Q8BJU2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms