Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prune1Q8BIW1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prune1Q8BIW1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prune1Q8BIW1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prune1Q8BIW1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prune1Q8BIW1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prune1Q8BIW1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prune1Q8BIW1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prune1Q8BIW1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prune1Q8BIW1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prune1Q8BIW1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prune1Q8BIW1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prune1Q8BIW1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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