Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdca8Q8BHX3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms