Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a7Q8BGY9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms