Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms