Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms