Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms