Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc172Q810N9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms