Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms