Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms