Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Pcsk9Q80W65 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Pcsk9Q80W65 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Pcsk9Q80W65 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Pcsk9Q80W65 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Pcsk9Q80W65 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Pcsk9Q80W65 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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