Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Avl9Q80U56 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms