Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl29Q80T74 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl29Q80T74 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl29Q80T74 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl29Q80T74 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl29Q80T74 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl29Q80T74 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl29Q80T74 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl29Q80T74 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl29Q80T74 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl29Q80T74 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl29Q80T74 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl29Q80T74 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms