Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Clec18aQ7TSQ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Clec18aQ7TSQ1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Clec18aQ7TSQ1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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