Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnkQ7TSL0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnkQ7TSL0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms