Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms