Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcg2Q7TMS5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcg2Q7TMS5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms