Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf2Q7TMI3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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