Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms