Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stambpl1Q76N33 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stambpl1Q76N33 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms