Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mindy1Q76LS9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mindy1Q76LS9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mindy1Q76LS9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mindy1Q76LS9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Mindy1Q76LS9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms