Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms