Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sbf1Q6ZPE2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sbf1Q6ZPE2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms