Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf653Q6YND2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms