Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Glis3Q6XP49 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Glis3Q6XP49 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms