Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms