Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8b3Q6UQ17 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms