Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc154Q6RUT8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms